Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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