Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BFSP2Q13515 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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