Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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