Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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