Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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