Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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