Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CSTF3Q12996 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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