Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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