Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms