Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SREBF2Q12772 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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