Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms