Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms