Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms