Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms