Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms