Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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