Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms