Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCDC1P59894 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms