Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB25P57735 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms