Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXG1P55316 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXG1P55316 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXG1P55316 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXG1P55316 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXG1P55316 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms