Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AQP4P55087 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AQP4P55087 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AQP4P55087 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AQP4P55087 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AQP4P55087 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AQP4P55087 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AQP4P55087 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms