Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms