Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV1P50549 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms