Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP214P35658 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP214P35658 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP214P35658 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms