Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCVRNP35243 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms