Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms