Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms