Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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