Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms