Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-FP30511 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms