Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms