Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms