Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RAB5AP20339 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB5AP20339 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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