Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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