Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDSO60760 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDSO60760 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HPGDSO60760 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPGDSO60760 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms