Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DENRO43583 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DENRO43583 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DENRO43583 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms