Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms