Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms