Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DXG7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DXG7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms