Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms