Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms