Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTF2Q9UNY4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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