Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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UBQLN2Q9UHD9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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UBQLN2Q9UHD9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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UBQLN2Q9UHD9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBQLN2Q9UHD9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBQLN2Q9UHD9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN2Q9UHD9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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