Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms