Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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