Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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