Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms