Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms