Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms