Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms